Основное решение

Включите второй способ поиска уже установленных на компьютер обновлений. При необходимости (и понимании последствий) включите опцию обновления из cf.

Дополнительная возможность

Либо (если вы по какой-то причине не хотите включать второй способ для поиска обновлений на компьютере) отметьте нужные базы галками и выберите из пункта "Ещё" команду "Обновить из cfu (или cf), который я укажу...":

Далее укажите файл с обновлением из нужной папки:

Обновлятор применит указанное обновление ко всем отмеченным базам и выполнит все необходимые регламентные процедуры.