Если в момент архивации основная папка для хранения архивов оказалась недоступна - обновлятор прямо скажет об этой ошибке в отчёте.

Далее обновлятор попытается использовать в качестве основной одну из дополнительных папок для архивации, если они указаны в настройках.

Если ему и это не удастся - тогда обновлятор, по умолчанию, будет использовать в качестве папки для архивации свою внутреннюю (стандартную) папку 'Data/Backups'.

Такое поведение может быть нежелательным, если, к примеру, обновлятор установлен на системный диск, на котором не предусмотрено свободное место для хранения архивов.

Отказаться от использования внутренней (стандартной) папки архивации в этом случае можно перейдя в дополнительные настройки программы, закладка "Системные настройки" и здесь в разделе "Дисковая подсистема" включить опцию "Не переключаться на внутр. папку для архивов, если недоступны основная и доп-ые":

В этом случае операция будет прервана из-за невозможности записать архив куда-либо.